Pour un auto-entrepreneur, le temps est la ressource la plus précieuse. Entre la prospection, la réalisation des missions et la gestion administrative, les journées sont souvent chargées. Pourtant, la gestion des factures et des devis ne doit pas être négligée : elle est le garant de votre professionnalisme et de la santé financière de votre activité. Avec l’arrivée imminente de la réforme fiscale de 2026, s’équiper d’un logiciel de facturation pour auto-entrepreneur n’est plus une option, mais une nécessité.
Quelles sont les fonctionnalités indispensables pour les auto-entrepreneurs ?
Un bon outil de facturation ne doit pas se contenter d’éditer des documents ; il doit devenir un véritable assistant de gestion. Voici les fonctionnalités que vous devez exiger :
- La simplicité d’édition : créer un devis ou une facture doit prendre moins de deux minutes. Recherchez des outils permettant de transformer un devis en facture en un clic ;
- La personnalisation : votre facture est un support de communication. Pouvoir intégrer votre logo, vos couleurs et choisir une mise en page soignée renforce votre crédibilité auprès de vos clients ;
- Le suivi des paiements et relances : un tableau de bord clair doit vous indiquer quelles factures sont payées, en attente ou en retard. Les meilleurs logiciels proposent des relances automatiques pour gagner du temps et réduire les délais de paiement ;
- La synchronisation bancaire : c’est l’atout majeur des solutions modernes. En connectant votre compte pro, le logiciel fait le rapprochement entre vos factures et les virements reçus. Plus besoin de pointage manuel ;
- Le calcul automatique des cotisations : pour un micro-entrepreneur, savoir exactement quel montant déclarer à l’URSSAF chaque mois (ou trimestre) est un confort inestimable.
Comparatif des meilleurs logiciels de facturation
Le marché propose des solutions variées, allant du 100 % gratuit aux suites ultra-complètes. Voici notre sélection pour orienter votre choix :
|
Logiciel |
Profil cible |
Point fort |
Prix |
|
Indy |
Freelances & Sociétés |
Tout-en-un (Comptabilité + Facturation + Compte Pro) |
Gratuit (offre de base) |
|
Abby |
Auto-entrepreneurs |
Partenariat direct avec l’URSSAF |
Dès 0€ / mois |
|
Henrri |
TPE / Auto-entrepreneurs |
Logiciel 100 % gratuit et illimité |
Gratuit |
|
Freebe |
Freelances aguerris |
Gestion du temps et rentabilité par projet |
Payant |
|
Tiime |
Indépendants |
Application mobile très intuitive |
Gratuit (facturation seule) |
Indy se démarque par sa capacité à centraliser toutes les tâches de l’indépendant : non seulement vous facturez, mais votre livre de recettes et votre registre des achats se remplissent automatiquement grâce à la synchronisation bancaire.
Comment être conforme à la réglementation ?
Utiliser un logiciel certifié est une obligation légale pour garantir l’inaltérabilité et la conservation de vos données comptables. Mais le véritable enjeu réside dans la réforme de la facturation électronique.
Le calendrier à retenir
Toutes les entreprises françaises, y compris les micro-entrepreneurs, vont devoir abandonner le format PDF simple envoyé par mail au profit de flux structurés (format Factur-X).
- 1er septembre 2026 : obligation de réception. Vous devrez être capable de recevoir des factures électroniques via une plateforme agréée comme Indy (anciennement PDP) ;
- 1er septembre 2027 : obligation d’émission. Toutes vos factures devront être émises via ces plateformes.
Les mentions obligatoires
N’oubliez pas que chaque facture doit comporter des mentions légales strictes : votre SIREN, vos coordonnées, celles du client, le numéro de facture chronologique, les dates et la mention « TVA non applicable, art. 293 B du CGI » si vous êtes en franchise de base.
Le choix de votre logiciel de facturation d’un auto-entrepreneur doit se faire sur le long terme. Anticipez vos besoins futurs (passage à la TVA, changement de statut en SASU/EURL) pour ne pas avoir à changer d’outil en cours de route. En optant pour une solution comme Indy, vous vous assurez une transition fluide vers 2026 tout en gardant une gestion simplifiée au quotidien.

